Obrady w Świątyni
Minęło kilka lat od wydarzeń z Kirkwall. Magowie i Templariusze nadal pałali do siebie nienawiścią i nie zanosiło się na pokój. Trwały ciąłe walki w wielu krajach. Boska Justynia zwołała Konklawe podczas, którego miała zamiar ustabilizować sytuację, gdyż tylko ona posiadała taką władzę. Niestety obrady zostały przerwane przez tajemniczy wybuch. Wielu Magów i Templariuszy zginęło pod gruzami Świątyni Świętych Prochów. Nikt nie wiedział co stało się z Boską. Dodatkowo na niebie pojawiła się ogromna wyrwa, z której wychodziły demony.
Znamię Szczeliny
W gruzach żołnierze znaleźli tajemniczą postać. Po kilku przesłuchaniach, więzień trafił pod nadzór Kasandry. Chociaż nie wiedział co się dokładnie stało i nie odpowiadał za obecne wydarzenia, to wciąż uważano go za niebezpiecznego.
Wspólnie z Kasandrą, Poszukiwaczką Prawdy oraz Lelianą, Prawą ręką Boskiej udali się do wioski Azyl, która leżała blisko Świątyni Świętych Prochów. Podczas drogi ujawniła się niezwykła moc tajemniczej, nowej postaci. Mogła zamykać wyrwy w Zasłonie, która odziela świat od Pustki.
Narodziny Inkwizycji
Po dotarciu na miejsce protagonista poznał Cullena, dawnego kapitana Templariuszy z Kirkwall, który po śmierci Meredith opuścił Zakon oraz Józefinę, dyplomatę z Antivy.
Po krótkiej naradzie wspólnie doszli do wniosku, że należy powołać dawno zapomnianą organizację - Inkwizycję. Należało dowiedzieć się co się stało, kto za to odpowiada i go pokonać.
Zostały rozesłane wici aby pozyskać nowych ludzi do wcielenia do armii. Jedyna nadzieja była w Magach w Redcliffe oraz Templariuszach w Reducie Therinfal.
Val Royeaux
Na początku nie każdy był przychylnie nastawiony do członków nowej organizacji. Kapłanki Zakonu otwarcie nazywali Inkwizycję Heretykami i wrogami. Herold miał rownież okazję przyjrzeć się temu, jaki stosunek mają do tego Templariusze oraz ich nowy dowódca. Nie bali się nawet podnieść ręki na kapłanki. Wszystko z powodu zerwania traktatu z Nevarry. Templariusze od tego momentu nikomu nie podlegali. Sam Lord Dowódca również dziwnie się zachowywał. Co wzbudziło pewne podejrzenia.
Sojusznicy
Zarówno sytuacja w Redcliffe jak i w Reducie nie wyglądała dobrze. Magowie walczyli w Kultem Venatorii a Templariusze byli pod wpływem Demonów.
Po tym jak Herold Andrasty zajął się sprawą i wcielił sojuszników do swojej armii, jedynym problemem pozostało zamknięcie wyrwy.
Gdy się to w końcu udało, Inkwizycja nie zdążyła nacieszyć się ze zwycięstwa, bowiem została zaatakowana przez armię na czele której stał tajemniczy Przedwieczny, który okazał się Koryfeuszem. Dawnym, Mrocznym Pomiotem, który był uwięziony w więzieniu Szarej Straży w górach oraz jak się wydawało zginął z rąk Hawke'a Bohatera Kirkwall.
Herold wymknął się z uścisku śmierci i wraz ze swoją nową rodziną tułał się aż dzięki pomocy Solasa jednego z jego towarzyszy dotarł do Podniebnej Twierdzy, która niegdyś należała do elfów.
Twierdza była ruiną i minęło wiele czasu zanim bohater przywrócił jej dawną chwałę.
Od tego momentu Herold Andrasty został okrzyknięty Inkwizytorem, dowódcą armii i nową nadzieją dla Thedas.
Powrót Hawke
Gdy poznano tożsamość tego, kto odpowiada za wszystkie ostatnie wydarzenia, Varrik sprowadził Hawke, chociaż wcześniej podczas przesłuchiwań Kasandry wypierał się, że nie wie gdzie się znajduje.
Bohater Kirkwall obwniał się, że Koryfeusz przeżył, lecz nikt nie przypuszczał, że udało mu się przeżyć starcie w górach Vimmark. Dlatego należało naprawić błąd z przeszłości i upewnić się, że antagonista już więcej nie powróci.
Problemy Szarej Straży
Największym wrogiem Mrocznych Pomiotów są Szarży Strażnicy. To właśnie Ci wojownicy, Łotrzykowie i Magowie od lat polują na kolejne Arcydemony i spychają pomioty w ich leża głęboko pod ziemia, dlatego idealnie nadawali się jako sojusznicze wojska przeciwko Koryfeuszowi.
Inkwizytor też o tym dobrze wiedział lecz nie wszystko było tak proste jak się wydawało.
Szara Straż znajdowała się pod wpływem Koryfeusza, który podstępem przy pomocy maga Erimonda, jednego z członków Venatori skłonił tutejszą Komendantkę, aby rozerwała Zasłonę.
Herold Andrasty wraz z wysłannikiem Szarej Straży, który jako jedyny nie był zmanipulowany przystąpili do oblężenia Twierdzy Adamant.
Oblężenie Twierdzy i Pustka
Inkwizytor wraz z Hawke oraz jednym z Szarych Strażników zaatakowali Twierdzę Adamant i próbowali przemówić do rozumu Clarel.
Chociaż wszystko zmierzało ku dobremu, to nikt nie spodziewał się ataku smoka i tego co przyszło po nim. Clarel poświęciła się w walce z pupilkiem Koryfeusza a Inkwizytor trafił fizycznie do Pustki.
Dzięki pobycie w Pustce Inkwizytor przy pomocy Ducha Boskiej poskładał szczątki swoich wspomnień i dowiedział się, co tak naprawdę wydarzyło się w chwili wybuchu kilka tygodni temu i skąd pochodzi jego moc.
Za wszystko odpowiedzialny był Koryfeusz, który przy pomocy tajemniczej kuli próbował wedrzeć się do Złotego Miasta. Lecz nie przewidział jednego, że ktoś przeszkodzi mu w rytuale i przejmie moc tajemniczego artefaktu.
Teraz zostało pokonanie pomiota jego własną bronią. Niestety drogę powrotną zablokował Demon Koszmaru i jeden towarzysz został uwięziony w Pustce.
Powrót z Pustki i Sytuacja w Orlais
Po powrocie z Pustki i decyzji w sprawie Szarej Straży, Inkwizytor powrócił do Podniebnej Twierdzy aby uzupełnić swoje siły by wyruszyć w głąb Orlais i położyć kres Wojnie Domowej, którą toczyła Cesarzowa Celene i Książe Gaspard.
Inkwizytor oczyścił Emprise du Lion ze wpływów czerwonych templariuszy i demonów oraz pozbył się Venatori ze Świętych Równin i Szmaragdowych Mogił. Jedyną rzeczą, która pozostała było załagodzenie wewnętrznego konfliktu o władzę.
Przyjęcie w Zimowym Pałacu i Powrót Morrigan
Wpływy Inkwizycji okazały się na tyle duże, że protagonista wraz ze swoimi doradcami oraz kompanami został zaproszony do Zimowego Pałacu na bal u Cesarzowej.
Podczas przyjęcia Inkwizytor spotkał Morrigan, Wiedźmę z Głuszy oraz uczestniczkę Piątej Plagi, która poinformowała o spisku wymierzonym w Cesarzową Celene, który miał na celu ją zdetronizować.
Inkwizytor dowiedział się, że za spiskiem stał Kult Venatori oraz Księżna Florianne.
Harold wkrótce rozprawił się ze zdrajczynią. Po ustabilizowaniu sytacji w Orlais i wyborze nowego władcy, Inkwizytor wrócił do Podniebnej Twierdzy gdzie czekała już na niego Morrigan.
Rozdroża
Morrigan zabrała Inkwizytora w głąb jednego z Eluvianu i pokazała Rozdroża - miejsce, które zawierało wiele elfickich luster i opowiedziała o tym, że Koryfeusz pragnie dostać się do Złotego Miasta za pomocą jednego z nich, który znajdował się w Dziczy Arbor.
Inkwizytor nie czekał długo i zebrał armię oraz wezwał sojuszników z Fereldenu i Orlais.
Studnia Smutków
Na miejscu okazało się, że wojska Koryfeusza już tu są i przemierzają Dzicz w celu znalezienia tajemniczej Studni Elfów.
Gdy Inkwizytor dotarł do bram Światyni Mythal, spotkał Koryfeusza i poznał jego sekret. Tak samo jak Arcydemon, Koryfeusz mógł przeżyć starcie wchodząc w ciało Szarego Strażnika. Tak oto przeżył spotkanie z Hawke'em.
Drużyna została zaatakowana przez Smoka z czerwonego Lyrium i musiała uciekać w głąb Świątyni gdzie spotkali Starożytnych Elfich Strażników pod przywództwem Abelasa.
Prawda na temat upadku elfów
Abelas opowiedział czym jest Studnia Smutków i uprzedził, że nie pozwoli nikomu się z niej napić. Starożytny wyjaśnił jak elfy zniszczyły Arlathan setki lat temu podczas wojny domowej i jak strzegą dziedzictwa od lat.
Dzięki nowym sojusznikom Inkwizytor pokonał wojska Koryfeusza i poznał sekrety Studni.
Spotkanie z Mythal
Po wydarzeniach z Dziczy Arbor, zaczęły dobiegać szepty, które kazały spotkać się z Mythal, dawną elficką Boginią.
Okazało się, że Mythal ukryła się w ciele Flemeth, matki Morrigan która kilka lat temu uratowała Szarych Strażników oraz Hawke. Mythal wyjaśniła co należy zrobić, aby osłabić Koryfeusza.
Ostateczna Bitwa
Koryfeusz nie czekał zbyt długo z kolejnym atakiem. Zdesperowany przypuścił atak tam gdzie zaczął. Osteczna bitwa miała mieć miejsce w ruinach Świątyni Świętych Prochów.
Podczas gdy na niebie rozgrywała się bitwa dwóch smoków, na lądzie Koryfeusz zmierzył się z Heroldem Andrasty. Bitwa była zaciekła, ale Koryfeusz został pokonany i uwięziony w Pustce a Wyłom zamknięty. Thedas było ocalone.
Szczęki Hakkona
Inkwizytor zaczął poszerzać swoje wpływy i zapuszczał się w kolejne regiony. Tak trafił do Kotliny Mroźnego Grzbietu zamieszkiwanego przez plemię Avarów.
Podczas obserwacji na jego drodze stanęło tajemnicze, wrogie plemię, które samo kazało się nazywać Szczękami Hakkona.
Hakkonici odnaleźli dawną Świątynię i pragnęli powrotu swojego Boga, Hakkona, który był tam uwięziony. W tym celu podstępnie zaprzyjaźnili się z Avarami z Grodu Kamiennego Niedźwiedzia aby wykraść im niedźwiedzicę by była naczyniem dla ich boga.
Pierwszy Inkwizytor
Po pokrzyżowaniu planu Thane'a Gurda Harofsena Inkwizytor udał się za nim do świątyni gdzie spotkał pierwszego Inkwizytora. Inkwizytor okazał się elfem o imieniu Ameridan, który to wiele wieków temu na polecenie Cesarza Orlais uwięził Hakkona, który chciał zaatakować nizinników.
Ameridan nie był w stanie pokonać smoka ale zdążył uwięzić go w czasie wraz ze sobą. Inkwizytor nie zdążył dowiedzieć się zbyt wiele o dawnych czasach, gdyż Ameridan był zbyt słaby i umierał.
Powrót Hakkona
Harofsen, który wyrzekł się wszystkich Bogów poza Hakkonem tak bardzo pragnął powrotu swojego pana oraz zemsty za to, że nikt nie pomógł jego ludowi podczas Plagi, że sam stał się naczyniem dla swojego bóstwa. Jednak wódz się przeliczył i był zbyt słaby, aby zmieścić całą duszę Boga, tak o to został przemieniony w Ożywieńca.
Po pokonaniu nieumarłego, Inkwizytor musiał zmierzyć się z Hakkonem Zimowym Odechem, smokiem który zawierał duszę Boga Avarów.
Potężny smok okazał się wymagającym przeciwnikiem lecz po długiej walce padł. Dusza Boga była wolna.
Trzęsienie Ziemi na Wybrzeżu Sztormów
Inkwizycja po powrocie do Podniebnej Twierdzy otrzymała raporty o potężnych trzęsieniach ziemi na Wybrzeżu Sztormów.
Inkwizytor wraz z drużyną udał się do podziemi gdzie spotkał Valte oraz Rena członków krasnoludzkiej ekspedycji Legionu Umarłych. Legion również natrafił na dziwne tąpniecia i na rozkaz Orzammaru miał to zbadać.
Po wędrówce w coraz to głębsze korytarze na Głębokich Ścieżkach i pokonaniu zastępów Mrocznych Pomiotów, drużyna natrafiła na tajemnicze istoty, w których żyłach płynęło Lyrium.
Istoty był wrogo nastawione i wyglądały na strażników jakiegoś sekretu. Kult nazywał się Sha-Brythol i strzegł potężnego Tytana.
W raz z kolejnymi krokami Inkwizytor poznawał tajemnice dziwnych krasnoludów.
Serce Tytana
Po śmierci Rena, Valta wraz z Inkwizytorem i jego drużyną natrafili na tajemnicze serce z lyrium, z którego wyrastały żyły. Okazało się, że Lyrium to krew tytana a wstrząsy były spowodowane samym tytanem, który się budził.
Niestety Inkwizytor nie zdążył dowiedzieć się więcej, gdyż został zaatakowany przez Strażnika Serca.
Po pokonaniu Strażnika, Tytan się uspokoił a tąpniecia ustały. Lecz coś się zmieniło. A dokładnie ktoś. Od tego momentu Valta nie była już taka sama.
Święta Rada
Po pokonaniu Koryfeusza i ustabilizowaniu sytuacji w Thedas oraz wyborze nowej Boskiej. Inkwizycja stała się bardzo potężną organizacją, której zaczęły się obawiać potężne królestwa Fereldenu i Orlais.
Tak o to zostało zwołane zebranie w Zimowym Pałacu gdzie miała zapaść decyzja w sprawie Inkwizycji.
Rada składała się z przedstawicieli z Fereldenu oraz Orlais pod przewodnictwem nowej Boskiej Wiktorii, która nie dawno należała do Inkwizycji.
Tajemnicze morderstwa
Podczas gdy Rada obradowała na temat tego, co dalej z potężną Inkwizycją, która po śmierci Koryfeusza i zamknięciu Wyłomu wydawała się zbędna, Inkwizytor mógł rozejrzeć się po Pałacu.
Tak oto natrafił na zwłoki wojownika Qunari co było niespotykane, gdyż nikt nie spodziewał się tutaj ich delegacji.
Próba Zamachu
Dzięki dochodzeniu udało się dowiedzieć, że Qunari działają za sprawą Vidasali, która wraz ze swoimi magami aktywowała Eluviany oraz zamierzała zacząć nawracać na Qun inne ludy. Za pomocą Ataashi, schwytanemu smokowi tworzyła Gaatlok aby siać zniszczenie na dużą skalę i podłożyła proch w Zimowym Pałacu.
Agent Straszliwego Wilka
Po oczyszczeniu Pałacu z beczek z prochem, Inkwizytor mógł zmierzyć się z Vidasalą w Fortecy Qunari - Darvaarad. Podczas starcia dowiedział się, że służy Agentowi Fen'harela, Solasowi.
Zdezorientowany Inkwizytor ruszył śladem Qunari i tak oto dowiedział się, że od samego początku był okłamywany.
Solas pociągał za sznurki i to właśnie on naprowadził go na Qunari gdy skierował martwego żołnierza do Zimowego Pałacu.
Po konfrontacji z Vidasalą i Saarathem, Saarebasem pod jej władzą. Inkwizytor natrafił na swojego dawnego kompana Solasa.
Straszliwy Wilk Powstaje
Po pozbyciu się Qunari i jej agentki, Solas wyjaśnił, że nie jest sługą Straszliwego Wilka a nim samym.
Niegdyś uwięził dawnych Bogów gdy Ci zabili Mythal. Lecz nie wiedział, że skazuje swój lud na zagładę. Teraz pragnie naprawić swój błąd i przywrócić dawną chwałę. Nawet jeśli będzie musiał zniszczyć obecny świat.
Solas nie obawiał się Inkwizytora i wiedział, że ten długo nie wytrzyma bólu który sprawiała mu nabyta moc. Pozbawił go daru, ucinając mu rękę i udał się w nieznane przechodząc przez Eluvian.
Nowi Sojusznicy
Po powrocie do Pałacu i decyzji co dalej z organizacją, Inkwizytor doszedł do wniosku, że Solas zna ich wszystkie sekrety i słabości. Aby go pokonać należało udać się do Imperium Tevinter i zdobyć nowych sojuszników, którzy pomogą w walce z Dawnym Bogiem.